Windows で作った CSV を Linux のツールに渡すと、改行コードの違いで 1 行として読まれることがあります。ここで CRLF ⇄ LF を変換しておけば、そうした事故を防げます。
セル内の改行（引用符で囲まれた改行）はそのまま保持し、レコード区切りだけを変換します。改行コードの混在したファイルは、多数決で判定します。